Foi na década de 1980 que a história do Educandário tomou um novo rumo. Um milagre atribuído à intercessão de Aníbal Maria Di Francia teria ocorrido na Capela do Educandário, tornando aquele espaço sagrado um marco no processo de beatificação do fundador dos Rogacionistas. A beatificação aconteceu em 7 de outubro de 1990, no Vaticano, pelas mãos de São João Paulo II.

          Pouco tempo depois, em 25 de outubro de 1990, Dom José Geraldo Oliveira do Valle, então bispo de Guaxupé, elevou oficialmente a Capela do Educandário à categoria de Santuário, conforme decreto baseado no Código de Direito Canônico. Segundo suas palavras, a decisão visava "o bem espiritual dos fiéis e o incentivo às orações pelas vocações sacerdotais e religiosas". 

          A cerimônia de instalação oficial do Santuário foi marcada para 18 de novembro de 1990, tendo como primeiro reitor o Padre Osni Marino Zanatta, RCJ. A data passou a representar o início de uma nova fase na história da presença rogacionista em Passos.

          Com a canonização de Santo Aníbal Maria Di Francia em 2004, um novo decreto foi emitido pela Diocese de Guaxupé, desta vez por Dom José Lanza Neto. A partir de então, o Santuário passou a ser oficialmente denominado Santuário Santo Aníbal Maria Di Francia.

          Ao longo de décadas, o Santuário tem sido um espaço de oração, missão e caridade, mantendo viva a espiritualidade rogacionista e acolhendo com amor e fé todos aqueles que buscam consolo, vocação e esperança.